俄罗斯海关实行垂直管理体制，统一管理全国海关，在组织机构上可分为四个层次：海关署、直属地区海关局（直属海关）、隶属海关、海关监管点。

俄罗斯海关官网：http://customs.ru/

俄罗斯海关共有8个驻外代表处（驻白俄罗斯、乌克兰、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、芬兰、德国、比利时和中国），海关学院1个、分院3个（拟增至6个）。世界海关组织欧亚经济共同体成员国教育培训中心设在俄海关学院，独联体地区信息情报联络中心设在莫斯科。